在《射雕英雄传》里面，有三条主线：北宋的败亡、郭靖的成长之路、《九阴真经》引起的江湖纷争。三条主线相互交织，共同铸就了一副荡气回肠的抗争之路。
金庸没有直接说《九阴真经》的具体内容，但是通过周伯通和郭靖的对话，让人们知道了躲在《射雕》之后的神秘人物——黄裳。
黄裳本是一介文人，在考取状元之后，本可以在福州郡守的位子上安安稳稳的做到退休。
然而，宋徽宗的出现，让黄裳的人生轨迹发生了剧烈的转变。
宋徽宗赵佶喜欢做皇帝，但是更喜欢画画、书法、奇珍异石。因为喜欢书法，独创了“瘦金体”；因为搜刮奇花异草，逼反了江南百姓。
玩够了艺术，赵佶又喜欢上了道教，走上了养生之道。他下令在全国搜集道教书籍，编成五千四百八十一卷，准备刊印。
当时全国的印刷中心在福州，赵佶想起了自己的状元郎黄裳，于是把校对刊印的工作交给了福州市长黄裳。
接到皇帝的命令，黄裳岂敢怠慢，皇帝当主编的书，出了差错，那肯定是要杀头的。黄裳日读万字，用了足足四年才校对完毕。
在校对的过程中，本无杂念，竟然悟透了里面的内功心法、道家武学、拳术、剑法、指爪、擒拿等上乘武功。
在他76岁那年，南方的方腊造反了，在很短的时间内攻克了六州五十二县，人数扩展到十几万人。方腊能够扩展的如此迅速，和他身为明教教主有关。
明教，又称摩尼教，原产自波斯，唐朝时传入中土，唐朝初年，唐王在全国建立明教寺院，支持明教传播。开元二年，唐玄宗下令禁止传播，明教转入地下，成为秘密的民间结社组织。明教认为，世界由光明和黑暗两种元素构成，教徒崇尚光明，惩恶扬善，与朝廷对抗。
张无忌是明教的人，朱元璋也是明教中人。在建立明朝之后，朱元璋深知民间结社的危害，严厉打击明教，下诏书“为首者绞，从者杖一百，流三千里”，在铁腕打压下，明教彻底销声匿迹。
黄裳领兵前行，凭借自身武功，连杀明教十几为护法、法王、散人、旗主，打败明教。
明教手下的人不全是波斯人，很多都是吸收的当时武林高手，这写护法、旗主的师叔、师弟肯定要报仇。
黄裳遭到武林人士的围攻，因为黄裳重点练习的内功修为，在拳法、招式上没有突破，黄裳被打成重伤，逃进了大山里面。武林人士为了泄愤，杀光了黄裳的家人。
黄裳躲进深山里面，冥思苦想破敌之术。经过四十年的潜心修炼，黄裳终于补足了拳法、剑术的不足，可以出来复仇了。黄裳行遍大江南北，当初的仇人早就相继死去，报仇已经不可能，黄裳深感时日不多，唯恐自身武学失传，临死之前把它们写进了一本书里面，藏在了隐秘之处，这本书就是《九阴真经》。
几十年后，《九阴真经》重出江湖，王重阳为了平息纷争，举行华山论剑，夺得第一，把《九阴真经》收入囊中，但是人家没有修炼真经上的武功，准备把它带入坟墓。
谁知在终南山遇见了虚竹儿子虚渊玄，以斗酒胜了王重阳，借来看了一眼《九阴真经》，感觉此经过于阴柔，于是在《楞严经》的基础上，创出了《九阳真经》，此经一出，又引起了一岀江湖纷争。